這個(gè)基因,讓細(xì)胞“攜帶記憶重生”!
作者:牧心
發(fā)布時(shí)間:2024-03-14
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如果讓你攜帶現(xiàn)在的記憶重生到童年,你會(huì)選擇記住當(dāng)年的高考答案,還是某期彩票的開獎(jiǎng)號(hào)碼呢?這種“攜帶記憶重生”的橋段也成為了很多網(wǎng)絡(luò)小說(shuō)的主題。雖然對(duì)于整個(gè)人來(lái)說(shuō)這還只是幻想,但是對(duì)于單個(gè)細(xì)胞來(lái)說(shuō),這一幻想已經(jīng)變成了現(xiàn)實(shí)!

2023年10月12日,中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組,聯(lián)合中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所張維綺課題組、任捷課題組,在《細(xì)胞-干細(xì)胞》(Cell Stem Cell)上,在線發(fā)表了題為Genome-wide CRISPR activation screening in senescent cells reveals SOX5 as a driver and therapeutic target of rejuvenation的研究論文。在論文中,作者報(bào)道了新發(fā)現(xiàn)的SOX5基因,可以讓細(xì)胞在不改變細(xì)胞身份(攜帶自身“記憶”)的前提下發(fā)生細(xì)胞更生,讓已衰老的細(xì)胞重新年輕活化。

這一發(fā)現(xiàn)為研究細(xì)胞衰老過(guò)程、治療衰老相關(guān)的疾病等問(wèn)題提供了新的研究思路。那么,這一基因是如何被發(fā)現(xiàn)的呢?它對(duì)細(xì)胞的更生又有哪些重要意義呢?

圖1 文章標(biāo)題截圖(圖片來(lái)源:cell)

抗衰之路的曲折探索

人體是由細(xì)胞組成的,人的衰老與人體細(xì)胞的衰老密不可分。細(xì)胞在執(zhí)行生命活動(dòng)過(guò)程中,隨著時(shí)間的推移,細(xì)胞增殖與分化能力和生理功能逐漸發(fā)生衰退,細(xì)胞內(nèi)基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞器也會(huì)發(fā)生顯著的改變。細(xì)胞不再像年輕時(shí)那樣充滿活力,各種反應(yīng)速度減慢,從而導(dǎo)致整體的生理功能也發(fā)生退化。

細(xì)胞衰老與機(jī)體的衰老及疾病等具有重要關(guān)聯(lián),深入研究細(xì)胞衰老現(xiàn)象,有利于預(yù)防和治療相關(guān)疾病。因此,科學(xué)家很早就開始研究細(xì)胞衰老過(guò)程中的分子生物學(xué),嘗試開發(fā)逆轉(zhuǎn)衰老的方法。簡(jiǎn)單地說(shuō),就是讓細(xì)胞得以“返老還童”,重新恢復(fù)活力。

此前,中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所劉光慧研究員及合作者,利用最新的體細(xì)胞重編程技術(shù),成功逆轉(zhuǎn)了兒童早衰癥患者身體中已經(jīng)衰老的成纖維細(xì)胞。

兒童早衰癥是一種罕見的遺傳病,患者在嬰幼兒時(shí)期就表現(xiàn)出皺紋、掉發(fā)、動(dòng)脈硬化、身體虛弱等一系列老年癥狀,并通常在13歲之前死于各種老年病。這種病的病因是基因突變導(dǎo)致的全身細(xì)胞的過(guò)早而不可逆的衰老。

圖2 兒童早衰癥患者(左圖),正常人類細(xì)胞核(右上)以及患兒細(xì)胞核(右下)(圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)2)

劉光慧研究員團(tuán)隊(duì)成功使得患者的成纖維細(xì)胞發(fā)生“時(shí)光倒流”,采用的方法是向細(xì)胞中注入“山中四因子”,這是2012年諾貝爾獎(jiǎng)獲得者山中伸彌發(fā)現(xiàn)的4個(gè)轉(zhuǎn)錄因子——Oct4、Sox2、Klf4、c-Myc(合稱OSKM),能夠使細(xì)胞發(fā)生時(shí)鐘逆轉(zhuǎn)。

雖然最后的結(jié)果是患病細(xì)胞的衰老得到了逆轉(zhuǎn),但“山中四因子”在治病的同時(shí)也帶來(lái)很多風(fēng)險(xiǎn)。其中最大的問(wèn)題是,山中四因子在使細(xì)胞“返老還童”的同時(shí)也一并擦除了細(xì)胞的分化狀態(tài),改變了細(xì)胞身份。重編程后的細(xì)胞雖然重獲新生,但它也失去了自己的記憶。

也就是說(shuō),細(xì)胞雖然“返老還童”了,但是徹底成為了無(wú)知懵懂的小孩子,不知道自己肩負(fù)的生理功能是什么了,雖然重新變得年輕,但卻忘了自己肩負(fù)的責(zé)任。

圖3 山中因子在體細(xì)胞重新編程中的作用

(圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)3)

還有一個(gè)問(wèn)題是,國(guó)際上很多科學(xué)家都在動(dòng)物身上嘗試使用山中因子來(lái)抗衰老,可是許多實(shí)驗(yàn)動(dòng)物后來(lái)都死于腫瘤或癌癥。看來(lái),想用這一招來(lái)對(duì)抗衰老,還有很多問(wèn)題要解決。
重新評(píng)估實(shí)驗(yàn)后,劉光慧研究員團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,山中因子可能還有些問(wèn)題。于是,他們踏上了尋找新的“衰老逆轉(zhuǎn)基因”的道路。

這次要尋找的新基因需要有如下幾個(gè)特點(diǎn):首先,能讓細(xì)胞重新年輕;其次,在變年輕的同時(shí)不能抹掉細(xì)胞的記憶,要讓它記得自己的功能;最后,盡量保證安全,不要產(chǎn)生太大的風(fēng)險(xiǎn)。

從頭求索,再尋“重生”基因

既然要做,那就做到徹底。劉光慧研究員團(tuán)隊(duì)以自建的人間充質(zhì)前體細(xì)胞體系為材料,對(duì)細(xì)胞里的兩萬(wàn)多個(gè)基因逐一進(jìn)行排查,看看到底哪些基因能夠起到延緩衰老的作用。

這一篩查過(guò)程應(yīng)用了一種稱為“CRISPR激活”的工具。CRISPR本來(lái)是一種常見的基因編輯工具,經(jīng)過(guò)改造后,這一工具可以為特定的基因帶去激活因子,使其發(fā)生功能增強(qiáng)。劉光慧研究員團(tuán)隊(duì)向細(xì)胞中的兩萬(wàn)多個(gè)基因逐個(gè)發(fā)送增強(qiáng)指令,觀察增強(qiáng)哪些基因可以起到細(xì)胞更生的作用。

經(jīng)過(guò)一番刻苦的排查,團(tuán)隊(duì)成功鑒定出了一系列的基因,這些基因在激活后,可以充分發(fā)揮延緩人間充質(zhì)前體細(xì)胞衰老的效果,因此,這一系列的基因都是我們對(duì)抗細(xì)胞衰老的潛在秘密武器。

而在這些基因當(dāng)中,有一個(gè)基因獲得了科學(xué)家的重點(diǎn)關(guān)注,這就是SOX5基因。從名字就可以看出,SOX5與山中因子里的SOX2是同一基因家族里的基因,并且SOX5的激活表現(xiàn)出了很強(qiáng)的促細(xì)胞年輕化的能力。于是,科學(xué)家圍繞SOX5進(jìn)行了一系列后續(xù)驗(yàn)證。

抗衰功能驗(yàn)證“三重門”

要證明一個(gè)基因有抗衰老的功能,需要三個(gè)方面的線索:在分子水平上,我們要找到基因互作的證據(jù),也就是這個(gè)基因會(huì)跟哪些基因相互影響;在細(xì)胞水平上,我們要看到這個(gè)基因?qū)τ诩?xì)胞衰老的逆轉(zhuǎn);在生物個(gè)體水平上,我們需要證明這個(gè)基因真的可以使衰老的生物器官重新年輕化。

在這幾個(gè)層面上,SOX5基因都沒有讓我們失望。

首先,在分子水平上,綜合運(yùn)用多種篩選技術(shù)后,科學(xué)家找到了SOX5的“接頭下家”——HMGB2基因,這個(gè)基因在之前的研究中被證明是一個(gè)衰老抑制基因。SOX5可以激活HMGB2的表達(dá),從而啟動(dòng)細(xì)胞的更生進(jìn)程。研究還發(fā)現(xiàn),如果抑制了細(xì)胞中的SOX5基因,那么HMGB2的表達(dá)也會(huì)受到抑制,細(xì)胞會(huì)加速衰老。因此,SOX5發(fā)揮作用的分子機(jī)制得到了證實(shí)。

圖4 SOX5基因是其他基因的遠(yuǎn)程增強(qiáng)子

(圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)1)

其次,在細(xì)胞層面上,SOX5的表現(xiàn)如何呢?實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),SOX5確實(shí)能夠讓很多種的衰老人類細(xì)胞重新年輕化,難能可貴的是,這種年輕化不是簡(jiǎn)單地“時(shí)光倒流”,而是在返老還童的同時(shí)沒有改變細(xì)胞的身份,就相當(dāng)于讓這些細(xì)胞在維持記憶的前提下重生了。

最神奇的是,SOX5基因真的可以在小鼠的身上起到“返老還童”的功能!為了研究SOX5基因在個(gè)體衰老中的功能,研究團(tuán)隊(duì)選擇了一批老年小鼠,在它們的膝關(guān)節(jié)中進(jìn)行了SOX5基因治療。老年小鼠的膝關(guān)節(jié)往往會(huì)有骨贅和滑膜增生、炎癥、軟骨磨損等衰老現(xiàn)象,而經(jīng)過(guò)SOX5治療的小鼠膝關(guān)節(jié)中,骨贅和滑膜再生受到了顯著抑制,而軟骨再生能力也得到了增強(qiáng),最重要的是,經(jīng)過(guò)治療后,老年小鼠的肢體抓力也獲得了顯著提升??磥?lái),SOX5基因真的讓這些“鼠爺爺”的腿腳重新年輕了一次。

圖5 用SOX5基因?yàn)槔夏晷∈筮M(jìn)行關(guān)節(jié)治療

年輕化效果明顯(圖片來(lái)源:參考文獻(xiàn)1)

當(dāng)然,這種為老年小鼠治療關(guān)節(jié)的事,山中四因子也能做,但是SOX5有兩個(gè)優(yōu)勢(shì)是山中四因子比不了的:首先,SOX5不會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞分化痕跡的擦除,也就是說(shuō)不會(huì)改變細(xì)胞身份,細(xì)胞仍然能維持原有的“記憶”;另外,相比于山中的四份基因來(lái)說(shuō),SOX5是單獨(dú)作戰(zhàn),DNA長(zhǎng)度更短,引起的副作用可能會(huì)更少一些,治療中也就更安全一些。

總的來(lái)說(shuō),這項(xiàng)研究為我們找到了一系列全新的細(xì)胞更生因子,對(duì)這些基因的研究會(huì)為我們對(duì)抗衰老帶來(lái)新的可能性,也進(jìn)一步加深了我們對(duì)于細(xì)胞衰老過(guò)程的理論認(rèn)識(shí)。而SOX5這一特殊基因由于其優(yōu)異的特性,可能成為對(duì)衰老相關(guān)的退行性疾病進(jìn)行干預(yù)的潛在靶點(diǎn)。

參考文獻(xiàn):

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[2] Scaffidi P, Gordon L, Misteli T (2005) The Cell Nucleus and Aging: Tantalizing Clues and Hopeful Promises. PLoS Biol 3(11): e395. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0030395

[3] Chiavellini P, Canatelli-Mallat M, Lehmann M, Gallardo MD, Herenu CB, Cordeiro JL, Clement J, Goya RG. Aging and rejuvenation - a modular epigenome model. Aging (Albany NY). 2021 Feb 24; 13:4734-4746 . https://doi.org/10.18632/aging.202712

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